自主招生和统招毕业证没有什么不同。

自主招生的意思就是大学计划招生的5%是可以通过自主来选择的，学生自主招生的考试合格后，就可以提前被录取到相应的专业中，与统招生的考试是一样的，只不过不用再参加高考了。

统招生，指通过参加由教育部组织的普通高等学校招生全国统一考试等正规化考试并被录取，毕业后由教育部颁发认证文凭的考生，包括博士研究生、硕士研究生、本科生和专科生。

参加高职自主招生未被录取的考生，可继续参加当年普通高考，已被录取的考生当年不得参加普通高考。通过高职自主招生录取的考生在学费、学历、待遇上与普通高职无异。